当扶苏与张良等人赶到那处时，正看到一众士卒将一具焦黑发臭的尸体从里面抬出来，扶苏看了两眼就看不下去了，他虽然见过无数的尸体，但是这具尸体还是太过难看，而且已经烧得完全辨别不出他的模样，所以扶苏问道：“这具尸体就是你们所说的子婴的吗？”
身边那来报于他的士卒忙道：“回皇帝，正是。”扶苏皱了眉问道：“他已经完全烧得变了形，你们如何肯定那就是子婴呢？”那士卒忙道：“只因我们在这尸体的身上找到这物件。”说话间便有人将一块玉佩递了上来。扶苏接过一看，发现虽然它也有被火烧过的痕迹，但或许是被那身体挡住的原因，又或许是玉质好的缘故，这玉佩还是晶莹剔透的，上面刻着的一条龙也是栩栩如生，扶苏知道当时能佩龙的只有皇室子弟，而经过这些年的折腾，皇室子弟就只剩下自己和子婴二人了，于是点头道：“不错，这正是能够证明子婴身份之物。你们可查清了子婴的死因了吗？他可是朕的兄弟，虽然以前与我为敌，但现在既然归降了朕，朕就不能让他死得不明不白。”
这个时候还没有仵作这个神圣的职业，对于凶杀案也没有系统的查探之法，最多就是向周围的人进行询问。可好似子婴房子周围的人或是在战场上被杀了，或是关押了起来，所以对适才所发生的事情无人知晓。那些士卒面露难色道：“我等仔细检查了一下，并没有找到什么线索，或许子婴大人只是一时错手点燃了房子，又或是。。。。。。”接下来的话他可不敢说下去了，他还怀疑子婴或是被扶苏下令杀死的，又或者是不甘受辱自杀而死。
扶苏明白他的潜台词，但他心里知道自己并没有派任何人来为难子婴。是的，自己对子婴是深有防备的，但却还不至于冷血到这个程度，最多只是心里想想，而且扶苏也已经想到了一个可以将子婴永远看住的办法，所以更不可能下手杀他了。但若说他是不甘受辱，就更说不过去了，如果这样，他大可在扶苏还没有进皇宫的时候就一把火将自己和这皇宫都给烧了，何必先投降再自尽呢？现在摆在扶苏面前的就只有两个可能，一是真如那人所说，子婴是错手失火而导致的被烧死，二则是被人杀了之后焚尸。而扶苏更倾向于第二点，因为若是失火的话，子婴大有逃出来的可能。当然其实还有一点，扶苏也考虑到了，那就是死的不是子婴，而是他找的一个替身，为的就是让扶苏错认为他已经死了从而放松紧惕，那子婴或还有再起的机会。但是现在咸阳城完全落在扶苏手中，子婴没必要在不曾得知扶苏心意的时候就冒着被识破的危险玩这一出。这样一来扶苏对那有人杀了子婴后烧了房子的判断就更坚定了。但要判断这一点就需要先证明子婴是否在火起之前就已经毙命了。
扶苏脑海中想到了自己看过的电视中就有这方面的故事，说是人若是死后被烧的，那他的口鼻中就无烟尘，反之则是满口烟尘。于是便命人橇开子婴的嘴巴细看，最终的结论是口中没有烟尘。扶苏说道：“他是被人杀了之后才被烧的，只是咸阳城中动乱刚过，无法查到是何人下的手啊。将他好好安葬了事吧。”说着便离开了此地。
其实扶苏此来的目的不是为了查案，而是为了确认死去的的确是子婴，现在他已经有八成把握认定那尸体是子婴，至于杀他的是谁扶苏反而不是那么想知道了。如果是自己手下的某个人为了替自己免除后患下的手，那自己查了出来岂不是很难办。所以扶苏走的时候也没有特意对那些人下令着他们要将凶手抓住。想来那些人也是聪明人，对这个已经没有权力的皇帝自然不会太过看重，扶苏既然不提，他们自然也是乐得轻松了。
但是扶苏想不到的是他的做法却惹来了张良的猜测。看着扶苏赶到那里之后只是确认了子婴的身份，对他的死却并不是太上心，张良便开始猜测这子婴是不是扶苏着人去杀死的。毕竟子婴的存在对扶苏来说并不是一件好事，现在他的作用已经没有了，扶苏除了他也是理所当然的。张良虽然自己下不了这个手，但对扶苏的这个做法他也是怀着乐观其成的态度的。只是张良对扶苏这个主公有了新的认识，对他产生了畏惧之情，这是扶苏所料不到的。
其后的一段日子里，扶苏便命攻城的士卒和守城的秦兵一起修缮起咸阳城来。那原先被扶苏军自己攻打得残破的城墙需要他们重新补好，那些为了得到更多的石木砸下城去而被拆的民居也要重新建起来，出城逃难的百姓则要召回来，一时间咸阳城从战场变成了建筑工地，那些拿惯了刀枪的士卒也拿起了工具。咸阳城在他们的不断努力下开始恢复了旧观，用不了多久，扶苏便可以在此登上皇帝之位了。
扶苏现在也没有什么大事需要操心的，所以他便在这皇宫之中东走走，西瞧瞧。这秦宫在历史上是毁于项羽之手，这个后世完全不可能看到的巨大建筑使扶苏充满了兴趣。在游览了大半个皇宫之后，扶苏才清楚为什么白居易会作那一首脍炙人口的《阿房宫赋》了。这里的一草一木，一房一柱都充满了匠心，同时也满是百姓们的血和汗，这或许就是秦最终会被刘邦项羽之流所灭的原因吧。其实若论真正的实力，刘项两者连起来也无法与秦相抗衡。“得道者多助，失道者寡助。这穷奢极欲的做法必然引起天下人的不满啊。我若想要改变大秦的未来就要从这一点做起。”扶苏一面看着这里的雕梁画栋，一面在心中不断地提醒着自己。但是这里既然已经建好了，扶苏自然不会清高到让人将他拆了以示自己的伟大，所以他也开始幻想起自己和小桃以及他们的子女在这里生活的场景了。
扶苏面带微笑地在宫里随意走着，不经意间走到了一个小小的殿宇之前，看它的规模和皇宫格格不入，甚至有些寒酸，扶苏就起了进去一看究竟之心。于是他唤来了已经变成他的内侍的原宫中人问道：“这里面是何所在，为何大门紧锁？”
那人是个年已五旬的老内侍，一听忙道：“皇帝，这殿宇是始皇帝时所造，他曾下严令任何人不得入内，便是洒扫也是他亲自所为。老奴实在不知内中是何乾坤。”
扶苏一听心中的好奇就更盛了，扶苏对秦始皇虽然尊敬，但也不会对他的任何一句话都照行不误，于是道：“将门打开，朕要进去一观。”那内侍想不到以前那两个皇帝都不进的门扶苏一来就想进去，但他还是应了一声，将门打了开来。
许是那殿门许久没有打开了，在内侍推开他的时候发出了骇人的吱呀声，扶苏大步走了进去，发现它确如外面所看到的一般，并不太大，里面或是久无人来的缘故，显得很是潮湿阴森，再加上那门很小，阳光无法照射进来太多，所以看里面的东西扶苏总觉得是模模糊糊的。“看来我应该去找个灯笼火把再进来一看比较好。”扶苏自言自语地道。突然他一抬头看到了墙上画着一幅画，画面上的是一个美丽的女子正在翩翩起舞，而在另一边则是两个男子正看得入神。虽然这时候的画技无法与唐代之后的相比，但扶苏一看就觉得这画中人栩栩如生，好象要从墙上走下来一般。但当他的双眼看向那两个男子的时候，却突然发现其中一人的头顶之上有两个小字：“该杀！”这两个字将整张画的意境都给破坏殆尽了。扶苏心中连连叹息，不知是哪个热年将这可作为国家一级文物的东西给破坏了。随即他想到这里只有秦始皇可以进来，莫非这字是他所写，那这画中人又或许和他有着什么关系不成？
扶苏索性便在这殿中四下里寻摸起来，果然在最上头的一张雕花案上，扶苏看到了一大捆的竹简，上面写满了字。看它的样式和上面的字，扶苏可以肯定它们应该不是什么书，而是有人写的日记。在好奇心的驱使下，扶苏慢慢地打开了其中一卷。
就当扶苏要细看之时，那内侍站在殿门外叫道：“皇帝，皇帝。张先生着人来报说上郡的人已经到了，现在正在宫外候着呢。”
扶苏一听，忙将手里拿着的竹简放回原处，急急站起身来就往外而去。现在咸阳城已经快要恢复旧时的模样了，他正在等着上郡的日呢一到就正式登基。而且他心中还一直挂念着已经有了身孕的小桃，不知她现在怎么样了。