赵铭给两个同知、六个佥事配备幕僚，使他们成为一个类似六部的职能机构，处理治下的政务。
赵铭自己也开幕，将浙东收服的华夏、王家勤等人，收为幕府书吏，来帮助自己处理政务，形成一个类似秘书处的班子。
现在马士鳌、陈明遇、陈于阶、冯京第、戴之俊、徐孚远、华夏、王家勤、杨文琦、屠献宸、董德钦等人，便是赵铭属下文官班底。
此外还有一个夏完淳在崇明，不过他并非浙江都指挥使司的官员，而是朝廷官员，备加了监军的头衔，算是朝廷派到东海，监视赵铭的人。
在过一段时间，夏完淳就将来到金塘岛，行使职责。
其实赵铭这么做，到不是想做军阀，只是这样做，能使得他紧握大权，不受外界干扰，不被人坑。
在任命说完后，赵铭遂即正色道：“现在职责划分后，本帅希望大家都能负责好各自的事务！”
众人纷纷表示会尽职尽责，各人脸上都带着兴奋之色。
赵铭微微颔首，“从明日起，各位便各自行使职责，将东海诸地治理好！”
现在赵铭控制的地方，主要有三处，崇明、舟山、台湾北部一小块区域，然后便是沿海众多岛屿。
赵铭对陈明遇道：“陈先生，这次本帅从浙东带回来不少人马和物资，你要召集书吏，尽快清点统计。原来金塘、舟山、崇明、台北四卫若是编蛮，可再设一卫，发往台湾屯田！”
浙江都指挥使司现在其实有五卫，还有一卫，乃是四明卫，只是这一卫，在四明山中，处于敌战区，不好直接管理，所以赵铭给王翊很大独立性。
明军一卫为五千六百户，每户出正兵一人，其余男丁为馀丁，赵铭的意思是，每满五千六百户，就可增设一卫。
这个卫，即是军事单位，也是行政单位，就相当于一个县。
赵铭准备以后得到的人口，达到一百二十户，就增设百户所，达到一千一百二十户就设千户所，达到五千六百户，就设一卫，并都发往台湾，以卫所方式来开发台湾。
台湾岛上有荷兰人，有西班牙人，还有少民，若是普通移民，肯定无法站稳脚跟，卫所既能屯田自足，又是军事组织，有一定战力，可以站稳脚跟，比普通移民更容易生存下去。
赵铭打算，开发完台湾，今后拓殖海外，也可以采用卫所制度。
陈明遇对于这些已有经验，他微笑起身，拱手道：“卑职领命，五日后，便会将文册呈于大帅案上。”
赵铭点了点头，陈明遇做事能直接说出期限，还是相当干练的。
接下来，赵铭又吩咐了一些事情，如各百户所设立蒙学，千户所设中学，卫设立卫学，鼓励各卫屯田开荒，倒也思路清晰，事事井井有条。
这让新投靠之人，都露出惊讶的神情，赵大帅不仅善于打仗，也能治理地方，颇有威势。
在处理完行政上的事情后，赵铭开始关注手下军队。
这次他从李成栋、郑成功、张名振处，借调了不少军官，同时也收拢了不少浙东义军，再加上原来的兵马，他已经有了一镇兵。
这些兵马同样需要建立一个军事体系，来进行管理。
不过此时，需要兵备科，先给新来的将士登记造册，赵铭便先将注意力，转移到了水师身上。
金塘岛，烈港，附近的船台上，六艘巨大的荷兰炮船，停在上面。
炮船旁边，工匠用树木搭了架子，工匠们正钉着木板，刷着桐油，修补着船只。
这六艘荷兰战舰，在金塘岛海战中，遭受了不同的损伤，三个多月过去，依然躺在船台上。
这时赵铭在陈于阶的陪同下，来到烈港，不时有水师战船，返回烈港，卸下一些粮食和物资。
赵铭虽回到金塘岛，但水师却并未回来，而是在沿海袭扰清军，夺取物资。
“夏收过后，水师运回来的粮食和物资，已经减少大半了。”郭忠随口说了一句。
赵铭微笑道：“如今已是八月底，秋收将近，届时水师要大展身手。”
赵铭说着，看向远处的船台，不禁问道：“六艘炮船，还未修好吗？”
陪同的陈于阶忙道：“大帅，有三艘已经修补得差不多，大概九月中旬，就能下水，另外三艘，则还需要等一等！”
赵铭十分看重这六艘炮舰，这是威胁满清的本钱，同时也是他争夺东亚海上霸主地位的资本。
这些船修好，还需要调派水手来，适应、掌握六艘炮舰，达到荷兰人操船的水平，估计要三四年的时间。
因此赵铭希望，船只能够尽快修好，以便水手能接过战船，进行训练，尽快形成战力。
赵铭微微皱眉，“这是为何？”
陈于阶道：“大帅，主要是缺少原料，舟山岛上没有合适的木料。修好的三艘船，还是因为拆了三艘破损严重的福船，才得到一些木料。”
造成的木料，需要阴干，放置两三年的时间，也就是说，舟山岛上即便有适合造船的木材，现在砍了也来不及。
“既然如此，那就再拆几条福船，用来修理炮舰！”赵铭沉声道：“若是如此，九月底，能不能全部修复？”
陈于阶忙抱拳道：“卑职尽力而为！”
赵铭微微颔首，忽然道：“舟山岛太小，适合造船的树木不多，陈先生着手准备一下，等船只修复完，派一批工匠前往台北，寻找合适的港湾，砍伐树木，储备木材，建立造船工坊。”
陈于阶愣了下，抱拳道，“卑职领命！”
“从造船这个事情，就能看出，水师一旦有了优势，就很难被人超越。”赵铭感叹一声，而后微微笑道：“如此看来洪老贼想要为满清训练水师，并非一件易事，本帅水师在海上，至少能保持十年优势，要是造船工坊做好，甚至能令满清始终无法超越本帅。”
台湾岛广阔，森林茂盛，有取之不尽的树木可以造船，却是比金塘岛更适合建立工坊。
陈于阶道：“大流球确实比舟山更适合造船，那卑职便在大琉球，建造造船工坊，金塘岛的船台，以后专门用来修补战船！”
赵铭点了点头，又吩咐道：“台湾岛上不仅有造船所需树木，岛上矿产易十分丰富，工科要派工匠，寻找铁矿、石炭、硫磺等矿，并着手开采！”
陈于阶听了微微颔首，抱拳道：“岛上匠户不多，不过卑职会尽力去办！”
赵铭闻语，沉声道：“若是匠户缺少，工科当设法，培养一批匠人出来。”
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